"Terwujudnya warga SMP Negeri 49 Jakarta yang berkarakter Pancasila, berprestasi, dan berwawasan global".

Dalam upaya mewujudkan Visi tersebut di atas, Misi SMPN 49 Jakarta adalah sebagai berikut :

1. Membentuk warga sekolah yang bertaqwa, berakhlak mulia dengan mengembangkan sikap dan perilaku religius baik di dalam sekolah maupun di luar sekolah.
2. Mengembangkan budaya mandiri, bernalar kritis, kreatif, bergotong royong, dan berkebinekaan global.
3. Menyelenggarakan proses pembelajaran yang merdeka bagi warga sekolah.
4. Mewujudkan lingkungan belajar yang mendukung perkembangan sosial psikologis warga sekolah.
5. Mewujudkan Sekolah Ramah Anak.
6. Mewujudkan budaya literasi di era digital.